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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 10 篇
收稿日期: 2018年11月26日 接受日期: 1970年01月01日 发表日期: 2020年05月25日
为探明低温胁迫处理对不同甘蔗转录因子表达的影响,以‘桂糖 08-1180’和‘ROC22’为试验材料,进行低温和常温处理,经转录组测序后,对转录因子基因的差异表达进行了分析。结果表明:测序共获得 360 404 条 Transcripts,183 515 个 Unigenes。低温胁迫下‘桂糖 08-1180’获得了 566 个差异表达转录因子基因,隶属于 61 类转录因子家族。‘ROC22’获得了 769 个差异表达转录因子基因,隶属于 71 类转录因子家族。2 个品种的差异表达转录因子基因表现为上调表达基因数多于下调表达基因数。ROC22 在 MYB、AP2-EREBP、GRAS、WRKY、NAC、Orphans、bZIP、FAR1、C3H、C2H2 等家族中具有较多的转录因子基因:‘桂糖 08-1180’在 AP2-EREBP、WRKY、MYB、Orphans、bZIP、NAC、GRAS、C2H2、FAR1、bHLH 等家族中具有较多转录因子基因。有 60 个转录因子家族包含了 2 个品种的差异表达转录因子基因,而 BES1、CAMTA、CPP 等仅含有‘ROC22’的差异表达转录因子基因,CSD 仅含有‘桂糖 08-1180’的差异表达转录因子基因。从差异表达倍数来看,2 个品种中均以表达倍数在 10 倍以下的转录因子基因最多。在‘ROC22’中,差异倍数较大的转录因子主要分布在 AP2-EREBP、Tify 和 WRKY 家族,在‘桂糖 08-1180’中,差异倍数较大的转录因子主要分布在 MYB、WRKY 和 AP2-EREBP 家族。本研究为甘蔗抗寒相关转录因子的挖掘及甘蔗抗寒性机理研究提供帮助。